Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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