Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 494.3 ms