Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms