Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms