Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms