Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms