Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms