Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms