Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms