Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd13P70217 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd13P70217 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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