Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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