Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps33bP59016 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms