Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rhbdl3P58873 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl3P58873 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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