Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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