Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GferP56213 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms