Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms