Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms