Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ptx3P48759 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms