Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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