Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Mmp9P41245 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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