Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PpardP35396 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PpardP35396 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PpardP35396 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms