Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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