Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms