Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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