Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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NelfeP19426 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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NelfeP19426 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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NelfeP19426 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NelfeP19426 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms