Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18528 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18528 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P18528 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms