Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtpraP18052 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtpraP18052 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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