Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Defa-rs1P17533 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Defa-rs1P17533 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Defa-rs1P17533 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa-rs1P17533 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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