Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms