Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fv4P11370 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms