Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms