Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms