Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P01649 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P01649 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms