Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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P01644 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01644 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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