Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms