Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms