Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh16O54909 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms