Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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