Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC117608.1-202ENSMUST00000224074 1049 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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