Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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