Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms