Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Kcnk3O35111 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Kcnk3O35111 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms