Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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