Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms