Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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MttpO08601 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms