Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6401L7N2C0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms