Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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