Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms