Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc180J3QNE4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms