Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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